PAINEL METAGENÔMICO RNA (LIQUOR)

Painel Metagemômica RNA 

Metodologia: Sequenciamento de nova geração (NGS) 

A técnica de Metagenômica RNA identifica fragmentos de RNA de microrganismos por técnica de sequenciamento de nova geração sem a utilização de primers específicos.

Na prática, isto significa que o material genético de todos os microrganismos presentes em uma amostra será sequenciado. A técnica laboratorial envolve a depleção de material genético humano (hospedeiro), amplificação randômica de RNA em dois passos adaptado de Greninger et al, confecção de bibliotecas e sequenciamento através da plataforma Illumina.

Os dados de sequenciamento são analisados por um pipeline de bioinformática in-house para comparação com bancos de dados públicos de genomas de vírus, bactérias e fungos.

Descartada a presença de contaminantes na amostra, a identificação de sequências de um determinado patógeno é precisa e inequívoca.